MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium populi BJ001 chromosome

Total Repeats: 155696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010725	TTG	2	6	38	43	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010725	G	6	6	52	57	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010725	GCA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010725	ATC	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010725	GCC	2	6	171	176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010725	AAG	2	6	219	224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579287
7	NC_010725	CGC	2	6	267	272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579287
8	NC_010725	TTCG	2	8	288	295	0 %	50 %	25 %	25 %	188579287
9	NC_010725	GAG	2	6	303	308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579287
10	NC_010725	GC	3	6	374	379	0 %	0 %	50 %	50 %	188579287
11	NC_010725	AAC	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188579287
12	NC_010725	TC	3	6	424	429	0 %	50 %	0 %	50 %	188579287
13	NC_010725	CGC	2	6	434	439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579287
14	NC_010725	CGC	2	6	455	460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579287
15	NC_010725	GCG	2	6	465	470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010725	ATG	2	6	519	524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010725	T	6	6	554	559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010725	CGA	2	6	591	596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010725	ACC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010725	GCCG	2	8	637	644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010725	TCG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010725	TTC	2	6	704	709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010725	CGC	2	6	721	726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010725	CTG	2	6	809	814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010725	CCG	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010725	GTC	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010725	CGA	2	6	935	940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010725	CGG	2	6	946	951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010725	GTT	2	6	977	982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010725	TTG	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010725	GCG	2	6	1023	1028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010725	CGG	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010725	GCT	2	6	1038	1043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010725	GCC	2	6	1053	1058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010725	GCG	2	6	1085	1090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010725	CT	3	6	1092	1097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010725	CGTCC	2	10	1117	1126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_010725	CCG	2	6	1130	1135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010725	GAG	2	6	1147	1152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010725	GCA	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
41	NC_010725	CGG	2	6	1248	1253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579288
42	NC_010725	GCGG	2	8	1256	1263	0 %	0 %	75 %	25 %	188579288
43	NC_010725	CGCC	2	8	1295	1302	0 %	0 %	25 %	75 %	188579288
44	NC_010725	GAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
45	NC_010725	GGCCGA	2	12	1412	1423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	188579288
46	NC_010725	CTCCG	2	10	1460	1469	0 %	20 %	20 %	60 %	188579288
47	NC_010725	CGA	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
48	NC_010725	CGC	2	6	1550	1555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
49	NC_010725	TGG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579288
50	NC_010725	CGC	2	6	1592	1597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
51	NC_010725	CGCT	2	8	1690	1697	0 %	25 %	25 %	50 %	188579288
52	NC_010725	CTG	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
53	NC_010725	CGC	2	6	1802	1807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
54	NC_010725	GCC	2	6	1815	1820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
55	NC_010725	ATCT	2	8	1842	1849	25 %	50 %	0 %	25 %	188579288
56	NC_010725	CCG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
57	NC_010725	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
58	NC_010725	CGA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
59	NC_010725	CCG	2	6	2055	2060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
60	NC_010725	CGA	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
61	NC_010725	CGG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579288
62	NC_010725	TCG	3	9	2113	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
63	NC_010725	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579288
64	NC_010725	CGA	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
65	NC_010725	GC	3	6	2147	2152	0 %	0 %	50 %	50 %	188579288
66	NC_010725	CCGC	2	8	2164	2171	0 %	0 %	25 %	75 %	188579288
67	NC_010725	GCCG	2	8	2213	2220	0 %	0 %	50 %	50 %	188579288
68	NC_010725	GCT	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
69	NC_010725	GC	3	6	2311	2316	0 %	0 %	50 %	50 %	188579288
70	NC_010725	CCG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
71	NC_010725	TGG	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579288
72	NC_010725	CCG	3	9	2461	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
73	NC_010725	GCC	2	6	2539	2544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579288
74	NC_010725	CGG	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579288
75	NC_010725	CAC	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579288
76	NC_010725	TGC	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
77	NC_010725	CGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579288
78	NC_010725	GCT	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
79	NC_010725	TGC	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579288
80	NC_010725	GGC	2	6	2686	2691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010725	GC	3	6	2711	2716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010725	GCG	2	6	2729	2734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010725	G	7	7	2746	2752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010725	GAC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010725	GC	3	6	2858	2863	0 %	0 %	50 %	50 %	188579289
86	NC_010725	CCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579289
87	NC_010725	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579289
88	NC_010725	CGATCC	2	12	2917	2928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	188579289
89	NC_010725	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579289
90	NC_010725	CGAC	2	8	2977	2984	25 %	0 %	25 %	50 %	188579289
91	NC_010725	CGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579289
92	NC_010725	CCA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579289
93	NC_010725	GC	3	6	3091	3096	0 %	0 %	50 %	50 %	188579289
94	NC_010725	CGC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579289
95	NC_010725	AGC	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579289
96	NC_010725	GAG	2	6	3288	3293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579289
97	NC_010725	CTA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579289
98	NC_010725	GC	3	6	3343	3348	0 %	0 %	50 %	50 %	188579289
99	NC_010725	TGCG	2	8	3355	3362	0 %	25 %	50 %	25 %	188579289
100	NC_010725	CAT	2	6	3434	3439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579289
101	NC_010725	TCG	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579289
102	NC_010725	ACG	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579289
103	NC_010725	GCG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579289
104	NC_010725	CGG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579289
105	NC_010725	CGA	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579289
106	NC_010725	TCG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579289
107	NC_010725	GC	3	6	3695	3700	0 %	0 %	50 %	50 %	188579289
108	NC_010725	GGC	2	6	3724	3729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579289
109	NC_010725	GAG	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579289
110	NC_010725	CCT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579289
111	NC_010725	TCCGGC	2	12	3970	3981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010725	CGGAT	2	10	3982	3991	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010725	AT	3	6	3990	3995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010725	GATCTG	2	12	4069	4080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188579290
115	NC_010725	ACG	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579290
116	NC_010725	CGC	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
117	NC_010725	CGG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579290
118	NC_010725	CGG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579290
119	NC_010725	CGG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579290
120	NC_010725	GCC	2	6	4290	4295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
121	NC_010725	GCCCCC	2	12	4339	4350	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	188579290
122	NC_010725	CGCGG	2	10	4417	4426	0 %	0 %	60 %	40 %	188579290
123	NC_010725	GCGCT	2	10	4510	4519	0 %	20 %	40 %	40 %	188579290
124	NC_010725	CGCC	2	8	4614	4621	0 %	0 %	25 %	75 %	188579290
125	NC_010725	CATC	2	8	4691	4698	25 %	25 %	0 %	50 %	188579290
126	NC_010725	CGA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579290
127	NC_010725	TCG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579290
128	NC_010725	GGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579290
129	NC_010725	CCG	2	6	4764	4769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
130	NC_010725	GCC	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
131	NC_010725	CG	3	6	4798	4803	0 %	0 %	50 %	50 %	188579290
132	NC_010725	ACC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579290
133	NC_010725	CGC	2	6	4872	4877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
134	NC_010725	GCT	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579290
135	NC_010725	GC	3	6	4944	4949	0 %	0 %	50 %	50 %	188579290
136	NC_010725	TCC	2	6	4973	4978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579290
137	NC_010725	CGC	2	6	4989	4994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
138	NC_010725	CGC	2	6	5008	5013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579290
139	NC_010725	TCG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579291
140	NC_010725	TCG	2	6	5307	5312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579291
141	NC_010725	GGCG	2	8	5430	5437	0 %	0 %	75 %	25 %	188579291
142	NC_010725	GTC	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579291
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144	NC_010725	GCT	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579291
145	NC_010725	GATC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	25 %	25 %	188579291
146	NC_010725	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579291
147	NC_010725	TGC	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579291
148	NC_010725	CGC	2	6	5629	5634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579291
149	NC_010725	ACG	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579291
150	NC_010725	TCGG	2	8	5699	5706	0 %	25 %	50 %	25 %	188579291
151	NC_010725	CGG	2	6	5711	5716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579291
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155	NC_010725	CGA	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579292
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160	NC_010725	GCA	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579292
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163	NC_010725	CGG	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579292
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167	NC_010725	ACCCG	2	10	6583	6592	20 %	0 %	20 %	60 %	188579292
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174	NC_010725	CAA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188579292
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251	NC_010725	GC	3	6	9745	9750	0 %	0 %	50 %	50 %	188579294
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258	NC_010725	GCCGC	2	10	10011	10020	0 %	0 %	40 %	60 %	188579294
259	NC_010725	CTG	2	6	10070	10075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579294
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262	NC_010725	CGA	2	6	10147	10152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579294
263	NC_010725	ATGC	2	8	10178	10185	25 %	25 %	25 %	25 %	188579294
264	NC_010725	GGCC	2	8	10210	10217	0 %	0 %	50 %	50 %	188579294
265	NC_010725	TCG	2	6	10224	10229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579294
266	NC_010725	GGC	2	6	10333	10338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579294
267	NC_010725	TCG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579294
268	NC_010725	GAG	2	6	10409	10414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579294
269	NC_010725	GGCG	2	8	10450	10457	0 %	0 %	75 %	25 %	188579294
270	NC_010725	CGC	2	6	10484	10489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579294
271	NC_010725	CGC	2	6	10496	10501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579294
272	NC_010725	GAT	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579294
273	NC_010725	GCTC	2	8	10554	10561	0 %	25 %	25 %	50 %	188579294
274	NC_010725	TCCC	2	8	10603	10610	0 %	25 %	0 %	75 %	188579294
275	NC_010725	C	7	7	10608	10614	0 %	0 %	0 %	100 %	188579294
276	NC_010725	GGA	3	9	10735	10743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579294
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279	NC_010725	GGT	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579294
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282	NC_010725	CCT	2	6	10909	10914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579294
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286	NC_010725	GCCCCG	2	12	11077	11088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_010725	GGC	2	6	11116	11121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_010725	CGG	2	6	11151	11156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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376	NC_010725	AGA	2	6	15088	15093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
377	NC_010725	CGAA	2	8	15095	15102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
378	NC_010725	CGC	2	6	15185	15190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579298
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382	NC_010725	TCG	2	6	15353	15358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579298
383	NC_010725	GCA	2	6	15402	15407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579298
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385	NC_010725	CGG	2	6	15452	15457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_010725	CGG	2	6	15499	15504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_010725	GCAT	2	8	15521	15528	25 %	25 %	25 %	25 %	188579299
388	NC_010725	TCA	2	6	15533	15538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579299
389	NC_010725	GCG	2	6	15545	15550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579299
390	NC_010725	CCGG	2	8	15553	15560	0 %	0 %	50 %	50 %	188579299
391	NC_010725	CGC	2	6	15567	15572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579299
392	NC_010725	GCG	2	6	15591	15596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579299
393	NC_010725	CGC	2	6	15633	15638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579299
394	NC_010725	GGGCC	2	10	15702	15711	0 %	0 %	60 %	40 %	188579299
395	NC_010725	CG	3	6	15742	15747	0 %	0 %	50 %	50 %	188579299
396	NC_010725	CG	4	8	15765	15772	0 %	0 %	50 %	50 %	188579299
397	NC_010725	GTC	2	6	15790	15795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579299
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444	NC_010725	CT	3	6	17835	17840	0 %	50 %	0 %	50 %	188579302
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497	NC_010725	GAG	2	6	20083	20088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579303
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